سنجش کمی C4 برای شناسایی افراد مبتلا به کمبود مادرزادی و یا بیماری های اتوایمیون مانند لوپوس اریتماتوی سیستمیک، آرتریت روماتوئید، بیماری سرم گلومرولونفریت ها، هپاتیت مزمن ،کرایوگلوبولینمی، بیماری کمپلکس ایمنی و آنژیوادم ارثی مورد استفاده قرار می گیرد. C4 ممکن است در کم خونی های اتوایمیون
همولیتیک افزایش یابد.
التهاب عصبى همراه با فعال شدن کمپلمان به طور جدی در پاتوژنز آلزایمر مطرح است . تعدادی از بیماریهای پوستی نیز همراه با کمبود نسبی و کامل C4 می باشند.