غلظت کلسی تونین هم در نوع تک گیر و هم در نوع فامیلی کارسینوم مدولری تیروئید (MCT) و در هیپرپلازی سلولهای C افزایش می یابد. سطوح سرمی کلسی تونین با حجم تومور و هم چنین درجه تمایز آن همسویی دارد. از کلسی تونین پس از عمل جراحی بیماران به همراه CEA برای پایش باقی مانده (residual ) ،عود و یا متاستاز تومور نیز استفاده می گردد. افزایش راجعه یا مداوم کلسی تونین پس از جراحی نشانگر عود یا تداوم وجود تومور می باشد. از کلسی تونین هم چنین در ردیابی زود هنگام موارد فامیلی و موارد تحت بالینی هیپرپلازی سلول C و یا کارسینوم مدولری تیروئید استفاده می گردد.