اندازه گیری CH50 بهترین روش برای ارزیابی عملکرد توالی سیستم کمپلمان است. CH50 مسیر کلاسیک را به خوبی ارزیابی می نماید و اغلب در SLE ،گلومرولونفریت و سایر بیماریهای کمپلکس ایمنی کاهش می یابد. سطوح کمپلمان در مواردی که بیماری اتوایمیون فعال است کاهش می یابند و کاهش آنها به مقادیر
غیر قابل شناسایی ، بیانگر نقص و کمبود ارثی یک یا چند جز کمپلمان است.
کاهش سطوح کمپلمان با افزایش شدت بیماری مرتبط می باشد.