C-ANCA اغلب در بیماران مبتلا به گرانولوماتوز وگنر دیده میشود که یک بیماری التهابی گرانولوماتوز نکروز دهنده متشکل از گرانولوم های اپی تلیوئیدی و سلول غول آساست، که مجاری هوایی فوقانی و تحتانی را به همراه واسکولیت
نکروزان عروق کوچک تا متوسط و گلومرولونفریت نکروز دهنده درگیر میکند .
P-ANCA در برخی بیماران مبتلا به بیماری گرانولوماتوز وگنر دیده شده اما از حساسیت و اختصاصیت کمتری نسبت به C-ANCA برخوردار است . P-ANCA اغلب در بیماران مبتلا به پلی آرتریت ،میکروسکوپی گلومرولونفریت هلالی و گاهی اوقات در بیماری التهابی روده (IBD) یافت میشود.